课程介绍:
学习方式
在线直播
每天1小时
视频回看
每周四次腾讯会议答疑 (课程结束后持续)
配套资料
自编配套教材
一整套分析代码和测试数据
3个月 Linux 服务器账号
适合以下人群参加
科研人员1.生物、医学等专业研究生、
2.公司生物信息工程师培训
课程目录:
第一天:chatGPT
1.chatGPT的使用
2.chatGPT提示词技巧
3.chatGPT plus 的开通和使用
4.chatGPT 插件的使用
第二天:Snakemake基础
1.流程自动化工具比较
2.Snakemake 安装
3.Snakemake 基础
4.Snakemake 全自动流程运行
第三四天:如何定义规则
1.搭建 RNASeg 自动化分析流程
2.从数据质控到差异表达分析
3.如何定义规则
4.如何自动实现任务的串并行
5.如何批量处理多样本
6.如何从配置文件读取参数
7.如何与conda、singularity 结合,使流程易移植
第五天:chatGPT辅
1.如何配置 chatGPT
2.让chatGPT自动完成流助开发程开发
第六、七天:网页报告生成系统开发实操
1生物信息分析报告技术路线
2.markdown、Rmarkdown、Bookdown 介绍
3.使用 Bokdown 进行网页版分析报告撰写
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