chatGPT—与生物信息全自动流程开发，慢直播

课程介绍：

学习方式

在线直播

每天1小时

视频回看

每周四次腾讯会议答疑 (课程结束后持续)

配套资料

自编配套教材

一整套分析代码和测试数据

3个月 Linux 服务器账号

适合以下人群参加

科研人员1.生物、医学等专业研究生、

2.公司生物信息工程师培训

课程目录：

第一天：chatGPT

1.chatGPT的使用

2.chatGPT提示词技巧

3.chatGPT plus 的开通和使用

4.chatGPT 插件的使用

第二天：Snakemake基础

1.流程自动化工具比较

2.Snakemake 安装

3.Snakemake 基础

4.Snakemake 全自动流程运行

第三四天：如何定义规则

1.搭建 RNASeg 自动化分析流程

2.从数据质控到差异表达分析

3.如何定义规则

4.如何自动实现任务的串并行

5.如何批量处理多样本

6.如何从配置文件读取参数

7.如何与conda、singularity 结合，使流程易移植

第五天：chatGPT辅

1.如何配置 chatGPT

2.让chatGPT自动完成流助开发程开发

第六、七天：网页报告生成系统开发实操

1生物信息分析报告技术路线

2.markdown、Rmarkdown、Bookdown 介绍

3.使用 Bokdown 进行网页版分析报告撰写